
Warren Hughes (Wallace Shawn) kommt unerwartet nach Eureka um den psychischen Zustand der Astraeus-Crew zu untersuchen. Allerdings scheint die Matrix immer noch Auswirkungen auf die Betroffenen zu haben: Sie tauschen unkontrollierbar Körper, so dass man sich nicht mehr sicher sein kann, wer wer ...
Ein Upgrade ihrer Borgimplantate führt bei Seven of Nine (Jeri Ryan) zu paranoiden Psychosen. Als die Voyager ein Alien trifft, der die Technologie besitzt, ihre Reise um Jahre zu verkürzen, glaubt sie an eine Verschwörung. Sie beschuldigt Captain Janeway (Kate Mulgrew) mit dem Fürsorger ...
Auf der Erde entwickelt Lieutenant Barclay (Dwight Schultz) einen Plan, um die Kommunikation mit der Voyager im Delta-Quadranten zu ermöglichen. Sein Vorgesetzter ist äußerst skeptisch und auch bei der Umsetzung trifft er auf erhebliche Probleme. Doch der ehemalige Offizier der Enterprise arbeitet unermüdlich weiter.

Die Kampfsterne Galactica und Pegasus greifen gemeinsam das Auferstehungsschiff der Zylonen an. Diese Schlacht wird den Charakter des Krieges für immer verändern: Beide Crews stehen vor der Entscheidung, wie weit sie gehen wollen, um zu überleben. Der Kampf entwickelt sich zum Kräftemessen zwischen Admiral Cain (Michelle Forbes) und Commander Adama (Edward James Olmos).

Präsidentin Roslin (Mary McDonnell) ringt auf der Krankenstation mit dem Tod. Da bringt ein Bluttest des ungeborenen Babys von Zylonen-Spionin Sharon (Grace Park) unerklärliche Ergebnisse. Roslin befiehlt eine Abtreibung. Aber ihr designierter Nachfolger Baltar (James Callis) protestiert: Wäre eine Kreuzung zwischen Zylon und Mensch nicht ein viel versprechendes Forschungsobjekt?
Sheriff Charles Swanson (John Callahan) ist verzweifelt. Auf seiner paradiesischen Tropeninsel verschwinden immer mehr Menschen spurlos. Gemeinsam mit Agent Marc Conrad (James C. Burns) will er der Ursache auf den Grund gehen. Doch die Wahrheit lässt den beiden das Blut in den Adern gefrieren: Dem ...